Nepisaka
Узус явно на стороне моего варианта. НКРЯ находит "осталось две минуты" и "оставалось две минуты", а вот "остались две минуты" и "оставались две минуты" — не находит. ИМХО, в этой фразе есть как фигура умолчания — не помню верный термин — слово "времени". Сколько времени оставалось? Две минуты.

Три рубля
Да, я тоже думаю, что там именно от слова время этот средний род.
И я бы тоже так сказала. Но вот когда пишу, хочется согласовать с тем, что есть.

А, я поняла, если речь просто об интервале времени, то глагол согласуется со временем, а если именно о минутах, тогда уже с ними. "Остались две несчастные минуты" - тут по-другому даже не скажешь.

Upd: скажешь. "Осталось две несчастных минуты."
😵