Идёте сюда: https://lk.fss.ru/ и делаете тык в "кабинет получателя услуг".
Там будет список больничных листов, статус должен быть, что больничный закрыт.
Если всё так, то просто дать номер больничного работодателю.
Если больничный ещё открыт, позвонить в медучреждение, и поругаться. Если ситуация не будет исправлена, сходить ножками к зав.отделения, там сидят более понимающие люди (если что, ФСС за такие залёты будет дрючить всех).

Вышеперечисленное справедливо для России, в Москве отдельное княжество, так что просто идите на приём к Собянину.