Реддл мог обеспечить алиби. Подобное в его характере...
О боже мой! Значит в тайной комнате кроме Гарри и подставной "одержимой" Джинни был ещё один ученик, тот кто по настоящему был одержим.
Волди захватил тело старшекурсника, украл Джинни, и устроил аттракцион для Гарри (с участием чар памяти вестимо), где тот уничтожил уже пустой дневник.
Вот оно что...