Мне кажется, тут было наоборот. Итак, по сюжету нужен младенец из пророчества, и с ним нужна интрига. Что за интрига? О, а пусть его подменят и потеряют. А кто может потерять младенца? О, а вон там у нас школьная подружка главного героя, сделаем её его сестрой. И пусть она ещё в разговоре с Дамблдором так невзначай эту тему затронет, чтобы закинуть намёк.
Это довольно-таки утрированно, но мне кажется, в первую очередь продумывался сюжет. Это потом уже герои выходили из тьмы, обрастая подробностями по ходу пьесы - ну и тут уж кому как повезло, какие черты перепали)
При этом я осознаю, что могу дико ошибаться.

А по поводу начальной точки сюжета мне очень нравится, как говорил Стивен Кинг: "Я просто беру кучку людей, забрасываю их в непредвиденную ситуацию и смотрю, как они выкарабкаются".