Из тысячи читателей только один оставляет комментарий, из тысячи авторов только одному наплевать на комментарии. Некоторые даже писать не могут в стол - им сразу нужен фидбек. Думаю, уже по этим критериям можно сделать вывод, что авторам комменты нужнее, и они должны быть там, где их легче увидеть, а не ходить куда-то ещё за ними.
По поводу ФвФ: мне всё равно, я не пользуюсь метками, закладками... у меня одна коллекция, из которой я все фф помню наизусть по авторам и названиям, но вот видеть свой фик, выложенный на фанфиксе, на каком-то новом сайте с фвф я бы не хотела, поэтому однозначно выставлю запрет/галочку - пусть только шапка висит, если уж без этого вообще никак.