Была же теория, что истинные мотивы Жнецов были обусловлены тем, что использование нулевого элемента приводило к тому, что чуть ли не ткань вселенной начинала разрушаться. В этом случае тотальная зачистка видится куда более логичной: куча рас использует нулевой элемент, причем не только для путешествий, но и в военных целях, а ведь еще есть и биотики, в том числе природные. Заставить отказаться от этого расы с разной историей, мировоззрением, да еще и, возможно, конфликтующие между собой практически невозможно - никто не захочет уступать, а смутная перспектива всеобщей гибели не подействует на тех, кому нулевой элемент и все, что с ним связано, нужны здесь и сейчас. Тогда синтетиков с нулевым тоже уничтожат, а если элемент единственная возможность для межпланетного путешествия, все синтетики рано или поздно его используют (логика) и попадают в расстрельный список.
Но... потом авторы решили сделать сюжет попроще и попонятнее.