10 мая 2020
|
|
ivan_erohin
В машинном масле не нашли, нашли в папайе. Там есть нюанс, что после таких приключений заподозрили не косяк теста, а кривые руки или еще что в лаборатории, поэтому сейчас ведется расследование на тему того, кто же неправ. Вообще, ПЦР сам по себе достаточно не точный индикатор в силу вечной причины - побочные продукты. Суть ПЦРа в том, что мы многократно умножаем некоторую ДНК, причем мы можем выбирать какую за счет праймеров - комплиментарных концам целевой ДНК последовательностей, который служат затравкой для этой самой реакции. Выбираем правильные праймеры в микс - умножаем правильные фрагменты ДНК. Праймеры, однако, не могут быть полностью уникальны - код большой, последовательности могут повторяться, поэтому надо задизайнить праймеры, которые максимально уникальны для целевого участка и целевого организма. Конечно, от какого-то мусора всё равно не деться, но его содержание - в идеале, бггг - окажется мало в сравнении с целевым продуктом. В результате - если говорить о положительном образце - на форезе, когда разделим наработанный продукт по массе, мы обнаружим много последовательностей, приблизительно - посмотрели на пятна в геле с пятнами маркера - похожих по массе (а следовательно и длине) на нашу искомую ДНК. (Там еще много ебли с температурой отжига праймеров, с концентрациями всего-всего, сменой праймеров, но это опустим для простоты) Несложно догадаться, что если изначальное содержание искомой ДНК в образце было слишком низко - не повезло - то ПЦР не доумножит сигнала так, чтобы его было видно через мусор. Если у кого-то в лабе кривые руки, и он напачкал образец, то тоже будет не оч хорошо. Если много нецелевых последовательностей в материале, то произойдет размножение мусора - при этом количество целевого продукта уменьшится, так как заложенные реагенты пойдут не на те реакции. Насколько я понимаю, тест отрабатывался только на человеках, поэтому я могу предположить, что в какой-нибудь папайе или где-то еще легко могут найтись нецелевые последовательности, комплиментарные праймерам, продукты ПЦР с которых при избытке такого материала легко загадят весь тест. (но я могу также предположить недобросовестность лаборатории, которая посмотрела на загаженный тест и сказала, что не переделывать же, пусть будет корона на всякий случай) Так что я бы тут подождала результатов расследования по лабе, во-первых, а во-вторых, все-таки смотрела на исследования на человеческом материале, для которого праймеры наверняка и дизайнились, потому что на все геномы не подизайнишь да и смысла особого нет. 2 |