Их банально вырежут дорнийцы, ибо Дорн никогда предателей не любил и кресло Семи Королевств их не интересовало (исторически), поэтому они вынуждены будут перейти на сторону главы независимого Дорна. Иначе этот глава просто назначит младших вассалов мятежных по отношению к себе домов главами новых домов и всё. Это все равно как спросить, кому подчинятся гномы в некоем общем фэнтезийном гномье-людском королевстве, если их глава объявит независимость, а часть кланов будет за людского короля. Обычаи и традиции, а также поддержка народа тоже играют роль. Поэтому мятежные по отношению к главе всех гномов кланы сами же гномы изгонят. Или их "рядовой состав" откажет старейшинам в легитимности.