Они уважают магглов как хомячков потому, что в мире магглов с точки зрения волшебников не ценятся индивиды, вернее, потому что магглы индивидуально бесконечно более слабые. Но магглов как "расу" они вполне себе боятся, иначе бы не скрывали так тщательно свое присутствие. Это можно посмотреть на точно таком же отношении к людям в других урбанистических фэнтези, скажем в "Досье Дрездена", где обычных людей разные сильномогучие расы (фэйри, вампиры и проч.) считают в основном добычей и пищей. Но вот когда заходит речь о таких структурах как армия, спецслужбы и вообще политика, там тональность резко меняется. Все прекрасно понимают, что, узнай люди о магическом мире - это сорвет баланс к хренам собачьим (простите за выражение). То же и в мире Гарри Поттера. Магглов не ценят индивидуально. Но коллективно-то вполне себе. Даже Волдеморт в основном претендует на владение миром магии и наказание "грязнокровок". Его не интересует вмешательство в мир людей, казалось бы почему? Нет, "потерроризировать" он может. Но управлять миром? Вроде бы такой цели не ставит. Потому как прекрасно понимает, что даже простая бомба от него мокрого места не оставит. Не говоря об атомной бомбе, биологическом оружии и проч.
Волшебников в мире, описанном Роулинг вообще мало. Я посчитал примерно в Британии их будет ок. 4000-5000 тыс. всего. Да, это ценные индивиды, но магглов-то в Британии миллионы. И так везде. Если "завеса" рухнет, то волшебникам не поздоровится. Сожгут на кострах или запытают в лабораториях. Без всякой жалости.