Эм. У меня вариант, которого нет среди предложенных - она не продумывала своих целей. Не убила бы - ну ок, не убила.
Убился всё-таки - ну убился. Последний из Блэков? - ну пичаль, ладно, пора к Лорду.

Fluxius Secundus
Главным подогревателем желания Беллы прикончить Тонкс стало её замужество с Люпином. Потому же она, возможно, не убила в Отделе тайн - тогда было не столь важно. Но когда узнала, что племянница позволила себе осквернить род настолько, что муж не просто какой-то там маггл, а ещё и оборотень (по сути, вообще не человек), - вот тогда "избавить родовое древо от поражённых хворью ветвей" стало делом принципа.
Имхо, чтобы для Беллатрикс задача стояла уничтожить при любых обстоятельствах в обязательном порядке, для этого должна быть какая-то принципиально веская причина.
А в случае с той же Тонкс - внимание на неё обратил сам повелитель - как тут не поставить себе цель № 1?

Ну а про откаты от убийства - увы, тут уже фанон. Из канона мы об этом знаем только то, что убийство/нанесение вреда ребёнку накладывает проклятие самой магии. И всё.