M J Jason, женский персонаж и мужской персонаж чаще всего дают разные направления для сюжета.

Объяснять сложно. Нужно конкретные примеры брать.
Есть у меня "808". ГГ по сюжету курит, живёт один. Логичнее прописать мужской персонаж.
Есть у меня "Я сажусь в машину". ГГ по сюжету не должен уметь хорошо водить. Стереотипично такое представление о женщине. Туда логичнее прописать женский персонаж.

Вот так и происходит.
Иногда бывает, что на первых порах формировании из идею плана работы персонаж может быть хоть какого пола. Здесь выбираешь потом только, исходя из того, куда движется сюжет. Он подскажет. ;)