поскольку природа анимагии неясна и она вполне может не являться трансфигурацией.
Нет, это форма трансфигурации. Finite incantatem прекращает действие заклинания, это так, но я не помню, чтобы при анимагии использовалось заклинание. Палочка точно не используется (иначе Сириус бы не превращался в собаку в Азкабане).