Я проголосовала за первый вариант, но вообще...
Скажем так, зависит от самостоятельности отдельных кусков (как собственно канон, разделенный на семь книг, имеет глобальный сюжет "победить Волдеморта", но в каждой книге есть отдельный квест, а то и несколько). Если у вас именно "ветка с цепочкой квестов", а не "один длиннющий квест с кучей этапов", то отчего бы и не разбить на серию.
(у меня, например, именно "один длиннющий квест", который разбить невозможно, дичь получается).