Asteroid
Тут надо смотреть, за счет чего идёт гениальность. Если за счет природного таланта к управлению чакрой и кеккей-генкаем в частности, то попаданец вполне себе сохранит этот талант. Ну, скорее всего. Во всяком случае, эта идея не вызывает больших претензий.
А вот сила воли - свойство характера. Личности. И это свойство было у личности Рока Ли. Это его характер. Не понимаю, с чего бы попаданцу его унаследовать.

Насчёт Кумо. Я как раз и смотрю на их охоту за носителями кеккей-генкая. Они в них заинтересованы.
Вот приходит такой мелкий пацан с развитым геномом льда в Кумо. Говорит: «хочу к вам». Ненавижу, мол, свою варварскую родину, где сплошь убийства и насилие, где вырезали мой клан и убили мать. Хочу в прогрессивное Кумо, где такие замечательные люди и такое сильное какурезато.
Будут ли такому челу в ноль промывать мозг и загонять в рабство? Нет, конечно. Да, будет слежка. Но попаданец же не планирует работать против Кумо или выступать против власти Райкаге. Пусть наблюдают - он будет самым преданным шиноби. Ближайшие лет 10 так точно, пока не наберется силы и опыта, не доработает свою пространственную технику зеркал и не свалит с её помощью в свой старый мир, где станет единственным суперменом.