Так, может, действительно, крестили так? Или, например, матери имя ребёнка не нравилось, и она продолжила называть так, как нравилось? Что, дескать, есть официальное, но кто ж смотрит, а есть -- домашнее. Например, Гуля Королёва из "Четвертой высоты", реально существовавшая девушка. Она же не Гуля, а Марионелла. Но об этом вспоминали лишь тогда, когда нужны были документы.

А паспортисты люди страшные. Деда в свидетельстве о рождении не Георгием записали, а Горгием, вот так бывает, опечаталась тетя паспортистка, увидели уже много позже и забодались доказывать, что там ошибка была. А в паспорте уже как надо. Но столько сил, беготни и денег на всякие справки.

Апд. В нашей студенческой группе был Муртаза, но мы об этом узнали только на одном из экзаменов где-то курсе на третьем. А так -- Миша и Миша.
И туда же: я всю жизнь знала, что есть дядя Толя, а он, оказывается, не Анатолий, а Антон. Почему? Не знаю.