В этой теории придётся обьяснить: а что такого в телепортации Хирайшина у Минато?
По призыву жаб и запечатыванию свитков мы видим, что это требует много чакры, и ручных знаков.
Так что очевидный ответ: Минато как-то смог оптимизировать затраты энергии, и заменил ручные знаки печатью. И сделал систему навигации, потому что телепортируется не от одной фиксированной точки в другую, а к любому маяку.
Это приличный обьем работы, но не супер дупер большой, как раз то, что может сделать одиночка за пару лет.