Короткий ответ: Потому что он не Гарри.
Гарри не сжег не Волдеморта, тот просто улетел. Гарри сжег Квирела, пытаясь сжечь Волдеморта.
Да, кстати, крестражу в голове Гарри тоже было плохо от защиты. Настолько, что он за годы заточения полностью потерял разум, и превратился в пускающий слюни, верещащий комок боли.