Роулинг в биографии Люпина это объясняла так:
После потери друзей и роспуска Ордена (в связи с исчезновением Волдеморта) мать Люпина умерла, и хотя Лайалл, его отец, всегда был рад видеть сына, Ремус не хотел подвергать спокойную жизнь отца опасности и возвращаться к нему.
https://translated.turbopages.org/proxy_u/en-ru.ru.886e9469-696fb8f2-370162dd-74722d776562/https/www.harrypotter.com/writing-by-jk-rowling/remus-lupin