//Поэтому я основываюсь на обычной логики путешествий во времени.
Вынужден вас обломать, в фантастике есть несколько взаимопротиворечивых схем путешествия во времени.
у Роулинг в ГП (но не в Проклятом дитя!) использована схема с детерменированным миром.
Признаки:
- прошлое нельзя изменить (прямо говориться Гермионой как правило)
- все действия путешественника в прошлом являются частью прошлого.
- в мире работают предсказания

Собственно мы наблюдаем прямые подтверждения детерминированности мира в последних главах ГПиУА - сначала мы видим действие при нормальном течении времени (и там отмечены странные события, звук за окном, патронус над озером) а потом ГП перемещается в прошлое и совершает действия которые и породили эти странные события.
При таком раскладе парадокс убитого дедушки невозможен, просто потому что прошлое нельзя изменить! Раз дедушка жив значит при путешествии в прошлое убить его не получилось.

// но Гарри у нас Избранный, он может победить Волдеморта, и если вызовет его на дуэль, то скорее всего сработает как раз те самые скрытые факторы из-за которых Поттер Избранный и он победит.

Эээ нет. Зелье тут не поможет.
Тут фокус тоже с детерминированностью мира и пророчеством.
Гарри не может победить Волдеморта. Этого нет в пророчестве. Он может сразиться с ним и один из них победит.
Но тут есть тонкость. В пророчестве подразумевается бой в котором Волди МОЖЕТ умереть. А у Волди крестражи, так что умереть он не может. Получается что пророчество говорит не о любой схватке с Волди, а лишь о той в которой у него не будет крестражей.
И что мы из этого получаем? "Кому суждено быть повешенным тот не утонет!" На ГП эта поговорка работает на все 100! Он обязан дожить до этого своего будущего боя (таково пророчество) следовательно он выйдет живым и из любого поединка с Волди, и с драконом, и с василиском, и с сотней дементоров.
Обязательно живым, но не обязательно победителем.
Так что будет если он выпьет зелье и пойдет биться с Волди до уничтожения крестражей? Зелье подскажет ему оптимальное поведение - не лезть туда! Впрочем может получиться и безумная дуэль при которой Поттер будет чудом уворачиваться от заклинаний и таки одолеет Волди и развоплотит его... Но не уничтожит, ведь крестражи то все еще есть...

//ещё пару применений зелья на допустим близких Гарри
нельзя пару раз применить зелье. Сдохнешь. Токсичное оно...

//Поттер ни разу не применял заклинания невербально, знал только теоретические аспекты, а под зельем применил,
Пытался, но у него не получалось. Это примерно как заниматься бегом и прыжками в высоту, а потом убегая от собаки запрыгнуть на забор который выше чем твой обычный рекорд. Допинг блин...