"А про Анну имел в виду, что она умеет проводить окончательную трансфигурацию, так как не тупо повторяет заклинание и машет палочкой, а осознанно выстраивает связи и использует те предметы, в которых есть нужные химические элементы... Чем не бонус для бизнеса?"

Тем что у нее мозги не заточены на организацию, управление и загребание денег. В первых главах, на мой взгляд, достаточно подробно рассказывалось о том, чем она занималась до Хога, а потому работа на производстве ей бы вряд ли подошла, не говоря уже о собственном бизнесе. Да и вряд ли бы ее способности окупились, т.к. на трансфигурацию она довольно много энергии тратит. Как раз из-за того, что она подходит к процессу осознанно, а не тупо машет палочкой, этот самый процесс нельзя поставить на поток.

"Вроде в "ГП и Методы рационального мышления" был прямой запрет на трансфигурацию того, что может попасть внутрь организма. И это правильно. Съешь вот так конфету, которая только что была поленом, магию сглючит - и всё... не откачают."

Так речь шла же не о трансфигурации чего-то в еду, а о размножении имеющейся еды. Хотя копии явно были бы менее вкусные, чем-то наподобие сои, скорее.