Летние каникулы десятилетнего Бена превращаются в кошмар, когда инопланетный артефакт насильственно врастает в его плоть. Омнитрикс — не игрушка, а живое био-оружие, где каждая трансформация пропитана мучительной перестройкой ДНК. Пока за устройством охотится космический титан Вилгакс, Бену предстоит раскрыть мрачное прошлое деда и решить: станет ли он защитником человечества или вирусным клинком, что сожжет Землю дотла.