Так мало ли, вдруг существует ветвь вишнуизма вообще вне теологии бхактов. Это же Индия, там и не такое чудо в перьях может найтись.
Допустим, речь о тех, кто понимает разницу. То есть, обычный верующий может в этих ваших философиях и не разбирается, но он знает примерно, что вон тот мудрец "наш", а вон тот не очень. Допустим, он знает это потому, что первый мудрец носит с собой кувшинчик, а у второго стеклянные серьги в ушах. Но мудрецы-то хорошо знают, какой именно веры держатся.

Три рубля, а те, кто понимает разницу, уже плохо делятся на шайвов-вайшнавов, потому что для них это чисто такое, внешне-наносное. БрАхман он ниргуна и имени у него нету.
Шанкара вообще отрицал всех богов как вымысел неучей.

Уровнем ниже, где школы, есть более-менее формальное деление (хотя сейчас нету, все стремятся зваться адвайтинами, потому что нутакое).
А ещё уровнем ниже Шанкара - аватара Шивы или как минимум шиванч, Мадхва - аватара Ваю и малая аватара Вишну, обоих надо очень почитать.

Я всё это к тому, что правильный вопрос - это "существует.существовал ли в известной нам истории ИНДУИЗМ традиции Шанкары", а правильный ответ - нет.