↓
 ↑
Регистрация
Имя/email

Пароль

 
Войти при помощи
Руконожка Онлайн
30 декабря 2020
Aa Aa
#реал #нереал #учебное
Запихали мы образец полипептида в умный прибор, чтобы узнать, какая структура у полипептида. Умная программа прибора выдала: 20% такой структуры, 30% сякой.... в сумме 146%. Преднастройки не решают проблему, значит или алгоритмы обработки, или пептид шалит. Казалось бы, что может пойти не так в дипломе, где даже статобработку самому считать не надо, а максимум - три раза запустить прибор для красивого графика.
30 декабря 2020
17 комментариев
У меня гамма-спектрометр любит выдавать отрицательные значения. Тоже очень весело смотреть на это.
А это все обслуживается какой-то рукодельной прогой?
Lендосспб Онлайн
какой-то умник решил столовские котлеты в спектрофотометр запихнуть, посмотреть чо там.
а спектрофотометр такой "ни единого следа аминокислот"
Руконожка Онлайн
Lothraxi
Эта прога настолько распространена, что ее используют все и везде. А мы просто повторили статью из нэйче, только у них в сумме выходит 100%
А пептид проверили на чистоту вообще?
Lost-in-TARDIS Онлайн
*биоинформатик вошел в чат*
А можно ссылки на статью и на программу умного прибора?
Именно 146% ?
Случайно ли именно такое число? ))
Jinger Beer Онлайн
В этой истории рассказывается о том, как ученые не смогли распознать полиморфную инопланетную субстанцию и совершить переворот в био- и прочей инженерии.
Вылили субстанцию в канализацию, взяли обычный пептид и получили обычные 100%...
Lендосспб Онлайн
Jinger Beer
а в канализации уже лежали котлеты, без единого следа аминокислот))
Jinger Beer Онлайн
Lендосспб
Jinger Beer
а в канализации уже лежали котлеты, без единого следа аминокислот))
И выпустив ложноножки начали гоняться за пептидами.
Новогодние научные ужасы.
Руконожка Онлайн
Руконожка Онлайн
XOR
у нас было одно вещество в разных растворах и в одном измеренном диапазоне длин волн было именно 146)
Руконожка Онлайн
Deskolador
порядка 90%. Остальное - полисахариды. Спектры у нас похожи с нейчеровской статьей, с небольшим сдвигом по оси длины волны.
Руконожка
Цепляться надо было за 146%
Вдруг что-то действительно мелькнуло :) А вообще удивился программе. Она ж ещё с прошлого века.
Руконожка Онлайн
Deskolador
о да, дизайн особенно доставляет. После каникул закину данные в другую программу - может чего изменится.
Lost-in-TARDIS Онлайн
опуская бурчание про то, что это старая как мамонты нейросетка, деконволюцию сейчас можно сделать лучше, они хотя бы её дообучают в версиях, а исходную статью сложно найти
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1409538/ Исходная статья.

Короче, программа допускает числа больше/меньше ста (см. выше бурчание), такое большое отклонение может возникать, потому что:
- Загрязнение => много шума. (в статье Nature чистота 94%, впрочем)
- Прибор/кюветка в нормальном состоянии?
- Если длина волны не в интервале, который знает сетка, всё тоже поедет. Какой диапазон длин волн?
- От Ph и того, что в чём у вас раствор, тоже зависит.
- Сетка может не знать ваш спектр, там в проге должны быть доступны спектры, на которых она обучалась, может иметь смысл сравнить.
- Можно сделать несколько измерений в одной точке и посчитать погрешность, в статьях с этой прогой так делают, там отклонение и в десяток процентов может набежать.
- Единицы ввода корректные?

Оно будет работать, только если оно максимально близко к тому, на чём обучалась эта сетка (там в проге должны быть спектры и условия). Если за них вылезли, то всё поедет.

Если есть вариант с более современной программой деконволюции, используйте его.
Показать полностью
ПОИСК
ФАНФИКОВ







Закрыть
Закрыть
Закрыть