Выскажу и я своё мнение. Фамилия Лили - Эванс или Поттер для меня не принципиально, хотя в фандоме действительно более распространён первый вариант. Для меня он привычнее, но это не так важно.
А с Риддлом-Вольдемортом вопрос сложнее. Это различие принципиально отличается от первого, так как уже сложились общие неписанные правила по использованию этих имён, а нововведение их ломает.
Если говорить об идеальной ситуации, то я был бы рад возможности поставить в поиск просто Доктора, или просто Мастера, чтобы вывелись все фики с их участием без разделения на инкарнации. Но отказаться от отдельных инкарнаций, сведя всё к одному имени, мне было бы неприятно.