тихо зашипев, оттого что шипы укололи его незащищенные пальцы, продолжил на секунду прерванное дело
— появится вероятность прочтения: "оттого что шипы укололи, продолжил". Да, по смыслу оно дикое, но грамматически оно станет возможным, а пунктуация нужна в том числе для того, чтобы двусмысленные прочтения исключать. Поэтому → "тихо зашипев оттого, что"