LilyofValley
Горьковская
Food park в ТЦ у метро (Великан парк)
В том же здании Марчеллис
На другой стороне Кронверкского, ближе к метро - небольшое, уютное кафе Моцарт.

Чкаловская
Гатчинская 17 - Паштейш и кофе - совсем маленькое (5-6 столиков), помимо паштейш (сладких и сытных) и кофе есть еще суп (подают в кружке :))
А еще почти напротив Чкаловской, на Чкаловском проспекте 16, Теремок - большой и свежеотремонтированный - мало ли, надо будет срочно где-то сесть и передохнуть. :)

Петроградская
Большой пр. ПС 74 - гинзовский Capuletti
На углу Большого и Ординарной - Счастье
На площади Льва Толстого - Буше (кстати, еще одно есть напротив Василеостровской, работает кажется с 8 утра)
На набережной Карповки 10 - Pita's (еще один в центре, возле метро Маяковская и в ресторанном дворике в Галерее)
Последние два не то, чтобы супер-уютные, но там хорошо готовят.
Если есть желание слипнуться всем организмом, то на углу Большого и набережной Карповки есть Синнабон.

Центр (Адмиралтейская- Невский)
Помимо той самой Пышечной на Большой Конюшенной
Марчеллис в доме Мертенса на углу Большой Конюшенной и Невского

Площадь Восстания
Можно в Обед-буфет в ТЦ Невский центр или - вычеркиваем, сейчас закрыт.
Eat market в Галерее (если пойдете в Eat market, то столик лучше искать на втором уровне - там посвободнее и только столики).