1) У Х и Y хромосом человека, емнип, около 5% гомологичных участков. То есть проще полностью заменить хромосому.

2) Генетически пол особи изменится мгновенно. Физиологически — зависит от возраста особи. Если это произошло в младенчестве — к моменту полового созревания ничто в особи не будет выдавать, что родилась она другого пола. Если же ближе к пенсии — вряд ли что-то в особи уже когда-либо сможет показать, что по факту особь не того пола, на который выглядит внешне.