Разве это не вопрос банальной арифметики?

Мы знаем себестоимость киловатт-часа и гигакалории "чистой" генерации того и другого, посчитанную описанным вами образом, знаем себестоимость производства "смеси" при комбинированном режиме работы (надо думать, данном конкретном режиме, с определённым соотношением тепла и электроэнергии), знаем объём генерации того и другого в нём.

Можно же определить, какая часть мощности станции в данном режиме работы тратится на генерацию тепла, а какая - электроэнергии.