У нас в стране церковь отделена от государства, на каком основании религиозный класс существует в светской школе? Есть ли документально подкрепленные одобрения соответствующих органов?

И плясать, исходя из ответа. Если класс официально одобрен в качестве, скажем, эксперимента, тогда обговаривать темы, которые нельзя затрагивать. Если нет - ехай нахуй (с), в светской школе светский учитель будет преподавать светскую историю. Не нравится - ищите священника-историка.