tanka-tarakanka

В принципе, мне ваша версия нравится.
То, что с самого начала планировалось две возможности: либо Гарри научится, либо нет, и тогда случится "проникнование со взломом" со стороны ВдМа, оба варианта приведут к поставленной цели и не подорвут доверие Тома к своему шпиону.
Есть некоторые нюансы, но они практически в любой версии есть.
Что касается этого:

Тут не соглашусь, пожалуй. Вряд ли у Гермионы был в то время такой статус, чтобы она могла по своему желанию "пойти за разъяснениями к директору"


Люпин, конечно, умный и тактичный, но в отношении СНейпа и он, мягко говоря, не всегда прав. Если он начал разговор с ""Что случилось?", может, они и поговорили нормально. А, если вдруг Люпин начал с "Какого Годрика ты... Ты должен немедленно... Иначе я всё Дамблдору скажу, он тебе устроит!", то Снейп, уже имея благословение директора на прекращение занятий, ничего бы объяснять не стал, а просто послал "Иди ты... за подтверждениями к Дамблдору"