Ну я бы всё же сказал, что одно другому не мешает. В смысле, что даже если Дамблдор не просто не препятствует поведению Снейпа (третированию отдельных учеников, поддерживанию вражды между Домами, общей манере ведения уроков), а напрямую поощряет его - это ещё не значит, что сам Снейп не желает именно так себя вести. По крайней мере, не могу вспомнить в каноне ничего, свидетельствовавшего бы об обратном.

Да и по поводу часто встречающегося оправдания в духе "Снейп должен был играть роль Пожирателя" - он вполне мог сказать ПСам, что находится под присмотром директора и потому должен изображать из себя "исправившегося и раскаявшегося". Собственно, тому же Краучу-младшему - реальному шпиону Лорда в Хогвартсе - никто не запрещал нормально учить студентов, в том числе и тем навыкам, которые они вполне могли впоследствии применить против самих Пожирателей и прочих сторонников Лорда.