"Так что для меня, к примеру, было странно, что она так и не смогла (пусть и не с первой попытки) превратить спичку в иголку. Сложности у нее возникали, насколько я помню по 6 главе, с превращением "живое в неживое" и "неживое в живое"."

Сложности у нее в принципе возникают с той трансфигурацией, где надо очень сильно менять хим. состав. Она может создать какой-нибудь великолепный фужер из песка, но не сможет превратить спичку в иголку или стол в свинью. И, кстати, трансфигурация сама по себе для нее очень затратна, намного больше, чем высшая боевая магия или та же авада, например.

"2) Освоила она зелья, чары и ЗОТИ (причём в последних двух предметах школьную программу изрядно опередила) и частично руны. Уже 3,5."

Опередила за счет того, что Снейп обучил нескольким темным заклянкам, которые не преподают в Хоге + что-то придумала сама. Но последнее, опять же, не является каким-то исключением. Снейп, будучи школьником придумывал заклянки, близнецы - тоже. Причем придумывали так, что на них другие чары не действовали стандартно.
По рунам, из-за того, что для Лапиной это в корне иная письменность, она пока прилично отстает и от Гермионы, которая изучала их с третьего курса (а Лапина все-таки делала упор на боевую магию и зелья), не говоря уже о Карле или Ассбьорне, которые, собственно, ее подтягивают.

"Да и в трансфигурации она не полный ноль. Кстати, с трансфигурацией интересная история: как превратить Бранау и Малфоя в хорьков, так на закон сохранения пофиг (а между тем масса хорьков куда меньше массы людей), а как спичку в иголку превратить, так про него мы сразу вспоминаем."

Еще раз повторяю: для Лапиной в трансфигурации ограничивающим фактором является сохранение химического состава, а не сохранение массы!

"3) Вы что, обиделись за Мери?.. И вообще, как ещё называть человека, который (пусть и с помощью еще одного мага) сумел без особых потерь отбиться от целой кодлы тёмных магов и свалить из ставки ВДМ?"

Эффект внезапности + недооценки. И если бы не АФ, то Лапиной бы и не удалось свалить. Если вы помните, он вначале наколдовал пару бомбард, создав панику среди пожирателей. Лапина ею воспользовалась и сбежала. Потом их окружили оборотни, и если бы не помог Снейп, то Лапина и Фольквардссон или погибли бы после долгих мучений, или пополнили бы ряды оборотней. И под конец пара читерских заклянок в исполнении самого Фольквардссона - их Лапина не смогла бы выполнить в принципе. Так что кто из них еще Мэри или Марти-сью?