chubush
Нил - территория Себека, и каким образом там оказался Апоп без пояснения - это такая же неувязка, как и уже замеченные вами

апд: если заняться натягиванием совы на глобус, то можно додумать, что Апоп, который изредка принимал облик крокодила убил/покалечил/устранил Себека и в его обличье стал управлять чужой вотчиной, неразумно и вредительски, что привело к засухе, потопу и т.д. (не представляю, для чего ему это нужно, разве только потому, что он вероломный) - тогда, да, некую логику события приобретают
вот только почему читатель должен додумывать