Там и раньше были проблемы с конвертацией, был период, когда курсив в FB2 вроде бы там вообще не отображался.

Попробуйте скачать EPUB. Или открыть FB2 через Блокнот/Notepad (сначала разархивировав, если он в архиве) и заменить вручную там все <emphasis> на <strong>, а </emphasis> на </strong>. По идее это должно превратить курсив в жирный шрифт, а с тем, возможно, не будет таких проблем. Ну или будут.

Кьювентри
да я в блокноте открыла.. оказалось испарился опять тэг - </emphasis>