Три рубля
Хз, если я правильно понимаю, что это, то в нашем мире это не работает, а мир ГП - это наш мир плюс магия (с соответственно изменённой историей, вестимо). Не, можно, конечно, переделать физику реального мира на какую-то другую, чтобы всякие субстанции-акциденции работали, но право слово, это очень, очень, очень сложно.

Почему "понятийные кластеры" сколько-нибудь "реальны"? Ладно если это вложено в интерфейс магии какими-нибудь богосоздателями всея волшебства, которые могли и физику менять по желанию. Хотя непонятно, зачем именно так (не вижу смысла), но допустим. Но если нет, т.е. если пытаться хоть как-то натянуть магию на естественность, то...

Матемаг, ГПшная магия сильно опирается на средневековую схоластику, алхимию и т.д., а те в свою очередь на Аристотеля. Сам термин «трансфигурация» — из богословских споров о пресуществлении евхаристических даров. Философский камень тесно связан с идеей первоматерии. В мире ГП всё это — реальность, и стоит лишь подсветить...
Здесь я должен был сказать что-то про мир идей и энтелехию (-: Тут важна красота концепции. Допустим, калач легче превратить в кружку, чем батон, из-за топологического сходства. Богатая мысль с чисто повествовательной точки зрения. Можно наконец писать, какую именно теорию изучают студенты в Хогвартсе. А что на физическую реальность это не налезает — это, кмк, проблема неразрешимая. И твои идеи с этой точки зрения не лучше.