Афаик, "все будет хорошо" в таких ситуациях используется как кривой парафраз "все, что ни происходит - к лучшему".
Как бы полную фразу произность не слишком невежливо, вот и обходятся заменителем.

"Когда горечь расставания меркнет перед радостью окончания работы." (цц)