Ну, это все задано каноном, у всех несообразностей оттуда "ноги растут" - так что, если писать фанфик, то, видимо, надо либо это принимать как данность (нелогично, да, ну что ж поделаешь? это мир Роулинг, а не реал), либо писать AU.
Кстати, и насчет тренировки на животных. Насекомое-то убить многим легко, тем более, если давить голыми руками не надо. А человека - куда сложнее. Так что вряд ли ауроры тренировались на паучках. Вот на оборотнях - может быть, только где же столько оборотней напасешься? Может, на каких-нибудь преступниках, а может. и на маггловских бомжах.
И при Крауче им вот именно что "разрешили" использовать непростительные, то есть официальный документ дали, что они имеют право их использовать, и ничего им за это не будет.
Но вряд ли они до этого документа не умели ничего такого. Тем более, документ-то распространял использование непростительных на ПОДОЗРЕВАЕМЫХ. Вероятно, при задержании на месте преступления, а также при оказании сопротивления - их и раньше можно было применять. Грюм-то убил Розье и Уилкиса не Ступефаем каким-нибудь.