Сразу замечание - с чего вы взяли, что префектов факультетов было по 6 на факультет? В моем хедканоне их двое. По канону у них столько обязанностей, что там и двоим-то делать нечего, а уж шестерым...
В норме студента назначают префектом на 5 курсе, и он остается префектом до 7 курса.
Если префект факультета "уходит на повышение" - становится префектом школы, на его место назначают другого.